余宏杰课题组博士后招聘启事

更新时间:2017-04-06  |  点击数:3187

(一)课题组PI简介

余宏杰,复旦大学公共卫生学院教授,博士生导师。获国家自然基金委“国家杰出青年科学基金”、教育部“长江学者特聘教授”、中组部“万人计划”科技创新领军人才、人社部“国家百千万人才工程”、科技部“中青年科技创新领军人才”、国家卫计委“突出贡献中青年专家”、“吴阶平-保罗杨森医学药学奖”、“树兰医学青年奖” 和国务院“政府专家特殊津贴”。主要学术贡献和发表论文见附件一和附件二。

(二)研究方向

课题组长期从事感染性疾病研究,研究领域主要是针对严重威胁全球公共卫生安全和我国人民健康的新发、重大传染病,包括Ebola禽流感、手足口病、登革热、狂犬病、布鲁氏杆菌病、季节性流感、肺炎链球菌和流感嗜血杆菌病等,运用多学科交叉技术,主要开展以下研究:

1.经典流行病学研究

通过监测、生态学研究了解不同人群中疾病分布的差异;开展观察性病例对照研究和队列研究,确定疾病的危险因素;开展随机对照临床试验,评估特异性预防和治疗措施的效果。

2.病人驱动的床旁临床和基础研究

从人群和患者个体水平两个维度,开展基础医学、临床医学和人群健康交叉的病人驱动的床旁临床和基础研究,涵盖病毒学、病原微生物学、免疫学、宿主和病原遗传学等多个学科,开展重要病原体变异变迁机制和分子进化规律的研究,在分子、蛋白、细胞和宿主动物水平上开展重要病原体与宿主相互作用的机制研究,重点进行病原体感染机制和宿主免疫应答机制等领域的研究,以加深对感染性疾病的传播、危险因素、病程、感染与免疫应答机制、发病机制、结局和治疗效果等科学问题的认识。

3.传播动力学研究

采用流行病学、数学、计算机科学、理论物理学、经济学、生物统计学、人口学、社会网络、行为科学等多学科交叉技术,构建和应用数学模型,对感染性疾病暴发和流行的发生、发展、演化过程进行流行病学分析、建模和模拟仿真,以阐明其传播动力学参数,模拟和预测其传播和演变过程,评估潜在干预措施的效果和经济学影响。

4.空间流行病学研究

通过多学科、多领域的合作,采用时间序列分析、人口动态理论、遥感、地理信息技术、空间统计和生态位模型等技术,研究人类、动物、疾病(病原体)、媒介、社会经济、自然环境等相互作用关系,估计疾病负担,预测其发病风险,绘制风险分布地图,阐明感染性疾病的时间、空间的流行特征及相关影响因素,为制定基于证据的防控策略提供科学证据。

5.改变政策驱动的疫苗研究

通过开展有针对性的、以改变政策为导向的研究,包括疾病负担评估,疫苗免疫原性、效力、效果和安全性评价,疫苗接种项目的成本效果分析、预算影响分析及疫苗需求预测等,促进新疫苗纳入国家扩大免疫规划项目,并制定基于循证医学证据的免疫政策。

(三)承担课题

2010年以来,作为负责人承担各类科研项目13项,包括国家自然科学基金委“杰出青年基金”、面上项目、国家科技重大专项、科技支撑计划、国家卫生计生委行业专项,以及WHO、美国NIH、美国CDC李嘉诚全球卫生基金会等国际机构资助的科研课题。

(四)发表论文和获奖

在国际期刊上发表SCI英文论文125篇,发表文章的IF1207,其中以第一作者或通讯作者(含并列)发表SCI 论文75篇,IF合计713,其中IF>10为15篇,包括在Lancet 5篇、BMJ 2篇、PLoS Medicine 4篇、Lancet Infectious Disease 3篇、Nature Communications 1篇。11篇同期配发专家述评,8篇以Fast track发表。Scopus SCI他引3216次,Scopus H-index 28。

作为第一完成人,获北京市科技进步一等奖、二等奖和三等奖各一项;中华医学科技二等奖一项、三等奖两项。

(五)博士后基本要求

课题组在复旦大学公共卫生学院常年招聘博士后多名。

1.国内外一流高校和科研院所已经或即将获得博士学位的预防医学(传染病流行病学)、临床医学(感染性疾病学、呼吸感染、神经系统感染、儿科感染)、病原微生物学、免疫学、遗传学、生物信息学、数理统计学(数学、生物统计学)、卫生经济学、地理信息学、生态学、计算机科学等专业的优秀博士生。

2.欢迎矢志成为感染性疾病及其相关交叉学科领域国际一流科学家的博士生加入课题组。

3.鼓励有志于在课题组现有研究方向上继续深入研究,更鼓励开展病原微生物学、免疫学、生物信息学、遗传学、大数据分析、数学模型、地理信息学、生态学和卫生经济学等多学科交叉研究。

4.有传染病流行病学、病原微生物学、免疫学、遗传学、生物信息学,或数学、生物统计学、地理信息学和卫生经济学的统计分析、建模,或感染性疾病的临床研究背景者优先考虑。

5.英文听、说、读、写熟练,作为第一或共同第一作者至少发表过2篇英文SCI论文,或1篇IF>5的论文,数理统计学、地理信息学、生态学、计算机科学专业的条件可以适当放宽。

6.善于沟通交流,有良好的团队协助精神,工作勤奋主动,严谨负责,有创新意识,能独立开展相关研究。

(六)博士后职位

Position 1: Post-Doctoral in patients orientated bedside clinical and basic research of infectious diseases

Key Responsibilities

l Designing and conducting patients orientated bedside clinical and basic research in basic medicine, clinical medicine and population health based on both the individual patients and the population. The research will focus on the variation and changing mechanisms as well as the law of molecular evolution of important pathogens. The mechanism study concerning the interaction between the important pathogens and hosts will be carried out at the levels of molecule, protein, cell, and host animal, paying close attention to the mechanisms of pathogen infection and host immune response. The objective of the research is to deepen our understanding towards infectious diseases in terms of transmission, risk factors, disease course, infection and immune response mechanism, onset mechanism, outcome and therapeutic effects.

l Presenting scientific findings to colleagues and at conferences, and publishing in technical reports or high quality journals.

Qualifications

l PhD in multiple disciplines including clinical/medical science of infectious disease, virology, pathogenic microbiology, immunology, host and pathogen genetics, or bioinformatics,

l 1 - 2 years of relative research experience, and

Ability to collate data, interpret and present results with high standards using a range of specialized research techniques.

 

Position 2: Post-Doctoral in Infectious Disease Biostatistics and Spatial-Temporal Modeling

Key Responsibilities

l Developing a range of mathematical and statistical models for the transmission of emerging or re-emerging infectious diseases;

l Spatial-temporal risk analysis and mapping, and optimizing intervention strategies for containment of emerging or re-emerging pathogens;

l Collating and analyzing epidemiological data with other types of dataset (e.g. population movement) relevant to the research project;

l Presenting scientific findings to colleagues and at conferences, and publishing in technical reports or high quality journals.

Qualifications

l PhD in epidemiology, biostatistics, geography, mathematics, ecology, computational biology, computer, medical science or a similarly quantitative discipline.

l 1-2 years of experience in mathematical and/or statistical models for infectious diseases or public health (including the work of dissertation), or

l Spatial-temporal modelling and risk mapping for evolution and transmission of infectious diseases, especially using the machine-learning algorithms (e.g. random forests or boosted regression trees).

 

Position 3: Post-Doctoral in Health Economics of Infectious Diseases

Key Responsibilities

l Evaluating the economic and disease burden (e.g. QALY and DALY) of infectious diseases;

l Analyzing data bases as needed to support development of economic models;

l Undertaking quantitative analysis and evaluation of the impact of prevention and control strategies (e.g. vaccination and medication) on financial budget, and health outcomes;

l Building and evaluating health economic or cost-effectiveness models for control and prevention strategies (e.g. vaccination and medication) of infectious diseases;

l Presenting scientific findings to colleagues and at conferences, and publishing in technical reports or high quality journals.

Qualifications

l PhD in economics, health economics or a similarly quantitative discipline or training.

l Research experience

l 1 - 2years of experience in infectious disease epidemiology, health economic modeling, or public health (including the work of dissertation).

 

(七)博士后待遇

1.博士后聘用期限一般为2-4年,年薪参照相同岗位正式职工的水平发放,并安排在站期间住房等必要生活条件;

2.博士后研究人员聘期内,参照正式职工,享受各类成果奖励,公费医疗或社会医疗保险,以及其他社会保险等福利待遇。并根据相关规定,其配偶及未成年子女可随其流动,子女入托、入学享受本校职工同等待遇;

3.课题组支持在站博士后申报博士后基金、国家自然科学基金,申请成功后归博士后独立支配使用,出站时推荐到国内一流高校和科研院所就业;

4.将选派具有创新学术思维和国际视野的博士后,到已与课题组建立了良好合作关系的牛津大学、伦敦卫生与热带病学院、普林斯顿大学、香港大学、美国CDC和美国NIH等院校和科研机构,进行联合培养,开展课题研究。目前课题组有4位青年骨干,在香港大学、英国南安普敦大学、伦敦卫生与热带病学院进行长期科研交流学习。

(八)联系方式

个人简历、个人陈述和简要研究计划发送至邮箱:cfetpyhj@vip.sina.com 

 

附件一主要学术贡献

1禽流感H7N9的传播动力学和干预措施研究

带领课题组创建了反转时间序列模型等方法,精确计算出了H7N9的潜伏期;发现了人感染H7N9病毒存在轻症病例,即其疾病谱存在冰山现象;利用bootstrap和生存分析技术,证明了H7N9疾病严重性低于H5N1,但比季节性流感和A(H1N1)pdm09高;利用Bayesian模型,首次定量证明了关闭活禽市场对阻断H7N9病毒从禽到人传播的有效性;构建了大空间尺度传播动力学模型,预测了H7N9在亚洲传播相对风险较高的地区。

这些系列研究成3篇发表在Lancet1BMJ1Nature Communications2篇Clinical Infectious Diseases等杂志。3篇Lancet论文均为最近10年被引频次排在相应学科领域Top 1%的ESI高被引论文,其中两项研究在Lancet同一期以快速通道发表,分别配发了美国NIH著名流感专家Cecile Viboud和英国著名动物源性传染病专家Guillaume Fournié撰写的述评,认为其中一项研究及时提供了当时最佳的禽流感H7N9疾病严重性的估计,另外一项充分证明了特定情形下,关闭活禽市场可有效阻断H7N9病毒从禽到人的传播

2甲型H1N1流感的基本流行病学参数和干预措施研究

带领团队组织实施了甲流轻症病例的队列研究,证明:1)病后48h内使用神经氨酸酶抑制剂,可显著降低甲流病例出现影像学确诊肺炎的风险,亦可减少热程和病毒RNA排出时限;2)甲流病毒自病人出现症状前1天排出,至病后8天,其排出时限较季节性流感病毒长;在国际上率先发现肥胖是导<60岁人群甲流重症病例的独立危险因素。此外,还确定了甲流的系列间隔、潜伏期、有效复制指数、罹患率和二代续发率等基本流行病学参数;证明了边境筛检在大流行早期可延缓其传播速度,关闭学校显著降低了2009年国庆期间的甲流传播强度,在密闭航班上佩戴普通外科口罩可有效阻断病毒传播。

以上系列研究成1篇发表在BMJ1篇Clinical Infectious Diseases2篇Emerging Infectious Diseases,对于建立1968年以来的第一次全球流感大流行-甲流基本流行病学参数的认识,并采取基于科学证据的防控措施具有重要科学意义。研究结果被WHO、美国疾控中心和中国卫生部广泛采用,制定甲流的防控指南。

3手足口病的流行病学研究

带领课题组开展了基于人群的手足口病流行病学研究,应用FourierWavelet时间序列模型,定量分析了引起手足口病的主要肠道病毒血清型EV-A71CV-A16在不同地理和气候区域的季节性,发现了与亚太地区其他国家以往报道完全不同的季节性变化规律。此外,还阐明了儿童分年(月)龄组手足口病的发病率、重症发生率、死亡率和疾病严重性等疾病负担的基本参数;确定了感染肠道病毒EV-A71血清型、低龄、农村居民、就医和诊断延迟是导致手足口病患者出现重症和死亡结局的独立危险因素。

此研究在Lancet Infectious Diseases以快速通道发表,杂志同期邀请国际著名肠道病毒专家Shimizu Hiroyuki教授撰写了述评,认为此研究是第一个全面的基于人群、对不同地理和气候区域的研究,所建立的手足口病发病基线,可成为亚太地区实施EV-A71疫苗免疫前的流行病学里程牌。该论文为最近10年相应学科领域Top 1%的ESI高被引论文,同时为最2年内发表的、最近2个月被引频次排在相应学科领域Top 0.1%的ESI热点论文。此研究结果为理解手足口病的基本流行病学特征、确定EV-A71疫苗使用的优先年龄组和免疫接种的起始月龄提供了基础性的科学证据。

2016年,课题利用EV-A71和CV-A16两种血清型双重循环的时间序列易感-感染-康复(TSIR)流行病学模型,准确捕获了手足口病传播的空间异质性和在不同地理气候区域的季节性变化规律,阐明了EV-A71和CV-A16的基本传播动力学参数,在国家和省级两个地理维度上精确估算了EV-A71和CV-A16的基本再生 (R0),据此计算出婴幼儿中EV-A71疫苗接种率需达96%,才能消除EV-A71的持续循环。同时发现EV-A71或CV-A16自然感染后可产生短暂的交叉免疫保护,EV-A71疫苗覆盖率越高,EV-A71相关手足口病的发病数下降越显著,而且EV-A71疫苗使用后,各省CV-A16相关手足口病的发病数与疫苗使用前的水平相近或仅有轻微上升。证明了单价EV-A71疫苗使用后,不会引起CV-A16所致手足口病发病水平竞争性上升,即血清型替换现象。此研究于全球建立基于据的EV-A71疫苗免疫策略具有重要科学意义,发表在PLoS Medicine。

4流感的季节性研究

创新性地利用含有谐波项的多元线性回归模型,替代了传统的小波谱分析,全球首次发现了A型和B型流感截然不同的季节性变化规律,推翻了国际科学界一直以来认为A型和B型流感在同一地理区域具有相同季节性的结论。此研究在PLoS Medicine发表后,引起国际流感界关注,美国NIH将其作为全球健康研究的热点予以专门报道。PLoS Medicine同期还邀请流感模型研究权威-伦敦帝国理工大学Steven Riley教授撰写了述评,认为本研究为设计流感疫苗的免疫策略提供了强有力支持。研究中最令人兴奋的发现是A型与B型流感完全不同的季节性变化规律。这项研究为WHO调整现行流感疫苗免疫策略,确定区域性疫苗推荐组份和最佳免疫时机提供了重要科学证据。

5疫苗的免疫策略及卫生经济学研究

课题组采用静态模型,从社会角度,以1倍人GDP的支付意愿阈值和3%的年度折现率为基线,EV-A71疫苗的成本效果进行了研究,并对模型参数和情景假设进行了不确定性研究和敏感性分析。结果发现,有效疫苗成本(EVC, effective vaccine cost,即100%疫苗有时进行免疫接种的所有成本包括疫苗、冷链运转、接种等)低10.6 (95%CI: 9.7-11.5)美元,可节约成本;如果低于17.9 (95%CI: 16.9-18.8)美元,仍具有成效果;如果所有缺失实验室数据标本且肠道病毒检测阴性的手足口病病例都是EV-A71确诊病例,则有效疫苗成本的上限可上升66%。

这项研究在EV-A71疫苗的实际成本确定前,以有效疫苗成本的形式,克服了病原学检测中较大比例的肠道病毒阴性结果对估计EV-A71真实疾病负担的影响,对EV-A71疫苗免疫进行了卫生经济学研究。研究结果对于全球建立基于证据的EV-A71疫苗免疫策略具有重要科学意义,发表在PLoS Medicine。

课题组还利用负二项和Serfling线性回归模型,全球首次发现了B型流感较A型流感更为严重的疾病负担。此研究发表在Bulletin of the World Health Organization,WHO大流行和流行病司司长Sylvie Briand为此研究撰写的同期述评指出此研究结果凸显了B型对重症流感疾病负担的重要意义。研究结果WHO在原有三价流感疫苗基础上推荐四价疫苗提供了重要科学证据。

 

附件二、代表性论文(通讯作者均标记*):

(一)禽流感H7N9H5N1

  1. Lai S, Qin Y, Cowling BJ, Ren X, Wardrop NA, Gilbert M, Tsang TK, Wu P, Feng L, Jiang H, Peng Z, Zheng J, Liao Q, Li S, Horby PW, Farrar JJ, Gao GF, Tatem AJ, and Yu H*. Global epidemiology of avian influenza A(H5N1) virus infection in humans, 1997 – 2015: a systematic review and meta-analysis. Lancet Infect Dis. Published online May 17, 2016 http://dx.doi.org/10.1016/S1473-3099(16)00153-5
  2. Yu H, Wu J T, Cowling B J*, Liao Q, Fang V J, Zhou S, Wu P, Zhou H, Lau E H, Guo D, Ni M Y, Peng Z, Feng L, Jiang H, Luo H, Li Q, Feng Z, Wang Y, Yang W*, and Leung G M. Effect of closure of live poultry markets on poultry-to-person transmission of avian influenza A H7N9 virus: an ecological study. Lancet. 2014, 383(9916): 541-548.
  3. Yu H, Cowling B J, Feng L, Lau E H, Liao Q, Tsang T K, Peng Z, Wu P, Liu F, Fang V J, Zhang H, Li M, Zeng L, Xu Z, Li Z, Luo H, Li Q, Feng Z, Cao B, Yang W, Wu J T*, Wang Y*, and Leung G M. Human infection with avian influenza A H7N9 virus: an assessment of clinical severity. Lancet. 2013, 382(9887): 138-145.
  4. Gilbert M*, Golding N*, Zhou H, Wint G. R. W, Robinson T P, Tatem A J, Lai S, Zhou S, Jiang H, Guo D, Huang Z, Messina J P, Xiao X, Linard C, Van Boeckel T P, Martin V, Bhatt S, Gething P W, Farrar J J, Hay S I, and Yu H*. Predicting the risk of avian influenza A H7N9 infection in live-poultry markets across Asia. Nat Commun. 2014, 5: 4116.
  5. Cowling B J, Jin L, Lau E H, Liao Q, Wu P, Jiang H, Tsang T K, Zheng J, Fang V J, Chang Z, Ni M Y, Zhang Q, Ip D K, Yu J, Li Y, Wang L, Tu W, Meng L, Wu J T, Luo H, Li Q, Shu Y, Li Z, Feng Z, Yang W, Wang Y, Leung G M*, and Yu H*. Comparative epidemiology of human infections with avian influenza A H7N9 and H5N1 viruses in China: a population-based study of laboratory-confirmed cases. Lancet. 2013, 382(9887): 129-37.
  6. Ip D K, Liao Q, Wu P, Gao Z, Cao B, Feng L, Xu X, Jiang H, Li M, Bao J, Zheng J, Zhang Q, Chang Z, Li Y, Yu J, Liu F, Ni M Y, Wu J T, Cowling B J, Yang W, Leung G M*, and Yu H*. Detection of mild to moderate influenza A/H7N9 infection by China's national sentinel surveillance system for influenza-like illness: case series. BMJ. 2013, 346: f3693.

(二)季节性流感和Pandemic H1N1

  1. Yu H, Alonso WJ, Feng L, Tan Y, Shu Y, Yang W*, and Viboud C*. Characterization of Regional Influenza Seasonality Patterns in China and Implications for Vaccination Strategies: Spatio-Temporal Modeling of Surveillance Data. PLoS Med. 2013, 10(11): e1001552.
  2. Yu H*, Liao Q, Yuan Y, Zhou L, Xiang N, Huai Y, Guo X, Zheng Y, van Doorn H R, Farrar J, Gao Z, Feng Z, Wang Y, and Yang W*. Effectiveness of oseltamivir on disease progression and viral RNA shedding in patients with mild pandemic 2009 influenza A H1N1: opportunistic retrospective study of medical charts in China. BMJ. 2010, 341: c4779.

(三)手足口病

  1. Takahashi S, Liao Q, Boechel TPV, Xing W, Sun J, Hsiao VY, Metcalf CJE, Chang Z, Liu F, Zhang J, Wu JT, Cowling BJ, Leung GM, Farrar JJ, van Doom HR, Grenfell BT*, and Yu H*. Hand, foot, and mouth disease in China: modelling epidemic dynamics of enterovirus serotypes and implications for vaccination. PLoS Med.2016, 13(2): e1001958.
  2. Xing W, Liao Q, Viboud C, Zhang J, Sun J, Wu J T, Chang Z, Liu F, Fang V J, Zheng Y, Cowling B J, Varma J K, Farrar J J, Leung G M*, and Yu H*. Hand, foot, and mouth disease in China, 2008-12: an epidemiological study. Lancet Infect Dis. 2014, 14(4): 308-18.

(四)疫苗的免疫策略及卫生经济学研究

  1. Wu JT*, Jit M, Zheng Y, Leung K, Xing W, Yang J, Liao Q, Cowling BJ, Yang B, Lau EHY, Takahashi S, Farrar JJ, Grenfell BT, Leung GM, and Yu H*. Routine pediatric enterovirus 71 vaccination in China: a cost-effectiveness analysis. PLoS Med.2016, 13(3):e1001975.
  2. Feng L, Shay DK, Jiang Y, Zhou H, Chen X, Zheng Y, Jiang L, Zhang Q, Lin H, Wang S, Ying Y, Xu Y, Wang N, Feng Z, Viboud C, Yang W, and Yu H*. Influenza-associated mortality in temperate and subtropical Chinese cities, 2003-2008. Bull World Health Organ. 2012, 90 (4): 279-88B.
  3. Yu H, Yang W*, and Varma JK. To save children's lives, China should adopt an initiative to speed introduction of pneumonia vaccines. Health Aff (Millwood). (Review) 2012, 31(11): 2545-53.